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2020年8月15日

九卅体育的研究人员回顾了D . 19的COVID-19介绍和影响.C. 地区

3月底,九卅体育APL分子生物学家彼得·蒂伦在九卅体育app医院的分子诊断实验室准备一台手持DNA测序仪.

3月底,九卅体育APL分子生物学家彼得·蒂伦在九卅体育app医院的分子诊断实验室准备一台手持DNA测序仪. Thielen和致力于对SARS-CoV-2基因组进行测序的跨企业团队进行了一项研究,描述了病毒早期传入国家首都地区的情况.

图片来源:九卅体育appAPL/Ed Whitman

汤姆Mehoke, 九卅体育APL的分子生物学家, 他于3月底在九卅体育app医院的分子诊断实验室研究测序数据.

汤姆Mehoke, 九卅体育APL的分子生物学家, 他于3月底在九卅体育app医院的分子诊断实验室研究测序数据.

图片来源:九卅体育appAPL/Ed Whitman

来自九卅体育和卫生系统的科学家们的努力 对SARS-CoV-2的基因组进行测序, 导致COVID-19的病毒, 对病毒早期传入国家首都地区的特征进行了研究. 在几个发现中, 该研究指出,该病毒多次进入该地区,但临床表现相似, 这表明,尽管遗传差异很小,但循环病毒可能引起相同的疾病. 这项研究还提供了有关实施隔离程序时病例进展的信息, 以及研究最终疫苗功效的方法.

九卅体育应用物理实验室分子生物学家发起工作,并使用软件和方法开发, 在某种程度上, 在劳雷尔的APL, 马里兰, 该团队早期的结论在研究中得到了突出体现, 哪个正在等待同行评议. 这项研究是由 JHU COVID-19研究应对计划, 该组织为快速反应小组提供了种子赠款,以便在COVID-19大流行期间找到解决方案并增加知识.

约翰·霍普金斯卫生系统诊断出马里兰州37%以上的早期COVID-19病例, 来自巴尔的摩-华盛顿都市区的患者. 其中114个诊断阳性样本的基因组进行了测序, 并对这些患者的疾病表现和结局进行分析.

通过分析, 该团队观察到SARS-CoV-2病毒多次可能传入该地区, 以及许多没有旅行或疾病接触史的患者, 这表明3月初该地区已经形成了社区传播. 他们没有发现的是病毒遗传变异和患者结果之间的明显联系, 例如医院或重症监护室(ICU)入院,这意味着他们发现病毒的谱系和患者感染的严重程度之间没有可能的联系.

“尽管在该地区的样本中观察到了遗传多样性, 从临床来看,这似乎是同一种冠状病毒,彼得·蒂伦说, 他是APL研究和探索发展部的分子生物学家,也是与Shirlee Wohl共同研究的主要作者之一. “九卅体育的数据没有显示患者结局和病毒基因型之间的联系.”

阅读更多有关 这里的研究.

该连接, 由临床和基因组序列数据组成, 让霍普金斯大学的研究团队进一步消除了新型冠状病毒有多种“毒株”的概念, 有些比其他的更致命.

最终的测序样本总数包括40个来自住院患者和22个来自ICU患者. 简而言之,作者写道: “病毒遗传的多样性, 临床症状, 患者的结果表明病毒突变并不是临床表现的主要驱动因素,他们“观察到严重的病例。, 定义为入住ICU(包括需要呼吸机支持的患者), 病毒基因组属于所有五个主要的系统发育[分组].”

“控制病毒在当地传播的努力可能受到疫情早期传入该区域的数量以及整个区域的相互联系的影响,作者写道.

该团队还观察到,针对最初SARS-CoV-2基因组的对策可能适用于所有COVID-19病例.

“针对单一菌株设计疫苗和治疗方法, 即使是一个有九卅体育在这里观察到的遗传多样性的人, 比快速变化的病毒简单多了, 比如流感,蒂伦解释道. “九卅体育在当地和全球数据中观察到的情况为这些领域的研究正处于正确轨道上提供了极好的保证.”

在论文中, 该小组追踪了病毒最初进入该地区的路径, 揭示了最近去过英国和北美其他地方(包括加利福尼亚)的患者的临床数据, 科罗拉多州, 纽约州和爱达荷州). 研究人员还将国家首都地区的遗传多样性与美国其他地区进行了比较.S. 和世界. 病毒种群的多样性 纽约市所描述的 似乎与国家首都地区相似, 这两个地区的疫情都曾多次播下种子.

病毒病原体的遗传特征需要从分子诊断到DNA测序技术的专业知识, 还有计算生物学和流行病学. 这篇论文的作者包括APL研究员Thielen, 汤姆Mehoke, 贾里德·埃文斯, 克雷格·豪视安科公司, 布莱恩•梅里特, 蒂娜Zudock, Kianna Blount和阿曼达 Ernlund. 来自九卅体育app医学院的研究人员, 怀廷工程学院和布隆伯格公共卫生学院由温斯顿·蒂姆普领导, 赫巴·穆斯塔法和斯图尔特·雷.

“这个跨学科团队代表了九卅体育的许多具体优势, 这对九卅体育了解美国COVID-19大流行的早期阶段做出了重要贡献.S.蒂伦说. “随着大流行的继续,九卅体育有了应对措施, 跟踪这些基因变化并确定病毒遗传之间的相关性将非常重要, 临床表现及对疫苗疗效的潜在影响.”

该小组将继续使用病毒测序技术在该地区监测COVID-19, 将马里兰州居家令期间收集的样本与该州逐步重新开放期间收集的样本进行比较. 这种分析将使研究人员能够更好地了解封锁的有效性以及该地区病毒传播的主要模式.

媒体联络: 阿曼达 Zrebiec,电话240592-2794, 阿曼达.Zrebiec@openbooknigeria.com

应用物理实验室, 九卅体育的非营利部门, 通过科学和技术的创新应用,应对国家面临的重大挑战. 更多信息,请访问 hispaniclatinoaffairs.multicultural.openbooknigeria.com.

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